13.10.2011 12:50

Imetajate genoomi “tumeaine” kaevati läbi

Piret Pappel
Skype:
novaator@ut.ee
Loe kommentaare (1)
Samal teemal (6)
Mõnda aega tagasi muutis inimese ja hiire genoomide võrdlemine molekulaarbioloogid üsna nõutuks – imetajate DNA on üsna sarnane, kuid tihti on geenide aktiveerimise regulatsioon palju olulisem kui pärilikkusaines endas sisalduv info. Geenide avaldumist reguleerivad faktoreid on seetõttu nimetatud ka genoomi tumeaineks. Kosmoloogiatermini kasutamine on igati sobilik – geenikontrollijaid on palju, nad on väga olulised, kuid vähe uuritud.

Geenide aktiveerumise uurimiseks pani Euroopa ja USA teadlastest koosnev uurimisrühm ritta 29 erineva imetajaliigi pärilikkusaine. Viie aasta jooksul võrdlesid uurijad genoome ja otsisid alasid, mis on kõikidel imetajaliikidel sarnase ehitusega. Mudelliikide hulgas olid nii inimene, küülik, nahkhiired, aga ka vööloom.

"Paari liigi DNA abil poleks olnud võimalik välja selgitada geenide avaldumist reguleerivaid ja kontrollivaid alasid. Nüüd suutsime kindlaks teha peaaegu kolm miljonit seni tuvastamata mittekodeerivat regiooni. Need on kõikidel imetajatel sarnased, muutused nendes piirkondades tekitavad inimesel haigusi," selgitas uurimuses osalenud Massachusettsi tehnoloogiainstituudi teadlane Manolis Kellis.

Genoomi mittekodeerivatest osadest on mutatsioone väga raske leida. Loodud andmebaas kergendab seda tööd tunduvalt.

Geenide avaldumist mõjutavate mutatsioonide tundmine omakorda aitab mitmete haiguste tekkemehhanisme tundma õppida ning leida ravivõimalusi. Uurimuse põhjal pakuvad geneetikud nüüd võimalikke funktsioone suurele osale imetajate DNA-st.

Näiteks leidsid uurijad ligi kümme tuhat konserveerunud pärilikkusaine järjestust, mis võivad mõjutada valgusünteesi ning peaaegu kolm miljonit geenide avaldumist mõjutavat transkriptsioonifaktorite seostumise kohta.

Lisaks pakuvad uued andmed infot ka imetajate evolutsiooni kohta. Tuleb välja, et saja miljoni aasta jooksul on imetajatel tekkinud kiired ja olulised muutused immuunsüsteemis, maitsemeeles ning rakkude jagunemist kontrollivates mehhanismides.

Samuti tõi uurimus välja need genoomialad, mis muutusid kiiresti inimesel ning inimahvidel. Nende lähem uurimine aitab paremini inimese evolutsiooni mõista.

Edaspidi lisatakse genoomiandmebaasi veel imetajaliike, mis muudab kogu analüüsi veel võimsamaks.

Uurimus ilmus ajakirjas Nature.

 

13.10.2011 13:55
Jaak Vilo

Manolis Kellise rühmas töötas ja avaldas oma esimesed Nature ja Genome Research artiklid ka meie oma Leopold Parts :-)

Lisa kommentaar

 

Mauricio Antón/PLoS 10.05.2012 10:14

Kust tulid inimesed jääaja lõpus Euroopasse? (1)

Kohe kui viimane jääaeg hakkas ilmutama taandumise märke, tekkisid Euroopas taas inimasustused. Värske geeniuuring annab aimu, kust need inimesed tulid.

RIA Novosti/Scanpix 08.05.2012 09:24

Kaukaasia ühtsus: geneetiliselt on piirkonna rahvad sarnased

Geneetiliselt on Kaukaasia rahvad palju lähedasemad, kui piirkonna kirju ajaloo ja seal kõneldavate väga erinevate keelte põhjal arvata võiks.

24.04.2012 13:08

Kuidas ravida kanapimedust?

Rakkude siirdamine aitab päriliku silmaveaga hiiri.

10.04.2012 13:58

Leiti laste ülekaalulisust põhjustavad geenid

Senitehtuist suurim rahvusvaheline uuring sõelus välja laste ülekaalu põhjustavad geenivariandid.

04.04.2012 15:30

Kas genoomi järjestamine aitab haigusriske hinnata? (1)

Lähiajal muutub DNA eraldamine ja uurimine taskukohaseks paljudele inimestele. Kas sellistest uuringutest on kasu?

02.04.2012 14:35

Sõrmejäljed reedavad pahesid

Sõrmejäljed lubavad paljastada narkomaane ja dopingupatuseid.

19.03.2012 15:26

Vereproov geenidopingu kasutamist ei näita

Geenidega manipuleerimist võimaldab tuvastada lihasest võetud koeproov.

12.03.2012 10:02

Kas taimed tunnevad kella?

Briti teadlased avastasid taimedel öist puhkeaega ja õitsemist reguleeriva geeni.

08.03.2012 09:25

Treening lisab rasva põletavatele geenidele vunki (2)

Sportimisest hoidumise ettekäändeid jääb üha vähemaks: kõigest tunniajane treening paneb geenid koheselt kiiremini rasvu lagundama, näitas värske uuring.

28.02.2012 09:22

Halb hingeõhk leidis ravis rakenduse (2)

Halba hingeõhku põhjustavat keemilist ühendit saab kasutada maksaravis, leidsid Jaapani teadlased.

21.02.2012 11:41

Tehisliha jõuab sügisel taldrikule (1)

Hollandi teadlased kasutasid lihaskoe saamiseks tüvirakke, et aasta lõpupoole valmistada laboris kasvatatud lihast esimene liharoog.

17.02.2012 17:04

Magus ja tervislik? On see võimalik?

Sisaldab kasulikke baktereid! – Taolist hüüdlauset on kasutatud pea igas jogurtireklaamis, mida kommertskanalitelt meile pesupulbri- või pampersipromo vahele näidatakse.

14.02.2012 10:08

Taimed teavad, millal röövikud ründavad

Taimed teavad, millal näljased putukavastsed rünnakule asuvad. Kuid nad suudavad end kaitsta vaid siis, kui nende sisemine kell on töökorras, näitas ajakirjas Proceedings of the National Academy of Sciences ilmunud uurimus.

10.02.2012 11:39

Geeniteraapia taastas nägemise (1)

Viiruse abil silma viidud geen parandab pärilikku silmakahjustust, näitasid Pennsylvania ülikooli teadlased.

07.02.2012 11:47

Kuidas genoomi-raamatut lugedes paremini depressiooni ravida?

Geenitest oleks lahendus nende jaoks, kellele sobiva depressiooniravimi leidmine ei taha õnnestuda.

03.02.2012 15:15

Uus seeneliik hävitab plastjäätmeid

Amazonase vihmametsadest leitud seen elab ära plastjäätmetest toitudes.

michael/flickr 24.04.2012 14:38

Samm tehiselu suunas: kunstlik DNA suudab evolutsioneeruda

Tehislik DNA suudab infot edasi pärandada, näitas ajakirjas Science ilmunud uurimus.

11.04.2012 15:31

Miks paber vananedes koltub?

Paber saab kollaka tooni tselluloosis valguse ja õhuhapniku mõjul tekkivate keemiliste muutuste tõttu.

09.04.2012 11:44

Tagasi Aafrika Eeva juurde (1)

Inimese põlvnemise uurimisel on juba üle 30 aasta olnud kasutusel eksitusi ja väärtõlgendusi põhjustav võrdlusalus. Eesti teadlased püüavad pilti õigeks keerata.

02.04.2012 18:05

Suurbritannia biopank tegi andmed uurijatele kättesaadavaks

Eesti Geenivaramust kümme korda suurem Briti biopank sisaldab poole miljoni inimese geeni- ja terviseandmeid, mida saavad kasutada kogu maailma teadlased.

20.03.2012 08:43

Tulevikutransistor on valmistatud verest ja limast (1)

Kiipide ja transistorite valmistamiseks kasutatava räni võivad tulevikus asendada orgaanilised molekulid.

15.03.2012 13:07

Lõheliim tõotab läbimurret haavaravis

Lõhekaladel paranevad vigastused tavatult kiiresti. See fakt on tekitanud teadlastes huvi, kas lõhedest võiks olla abi inimeste ravimisel.

08.03.2012 12:13

Vähk ei lase end paljastada

Koeproov võib jätta vähkkasvajast vale mulje.

29.02.2012 15:40

Eesti teadlase andmed aitasid leida jäämees Ötzi sugulasi

Kui palju on tänapäeva eestlasel sugulust iidse jäämees Ötziga? Nagu igal keskmisel eurooplasel.

23.02.2012 10:38

Kuidas ehitada dinosaurust?

Teadlased kasutavad robotdinosauruse ehitamiseks vajalike luude valmistamiseks 3D-printereid.

20.02.2012 17:03

Artiklid ülinakkava linnugripi kohta ilmuvad lähiajal

Piisknakkuse kaudu levivat linnugrippi puudutavad artiklid ilmuvad nii ruttu kui võimalik. Nii otsustasid möödunud nädalal nõu pidanud viiruseuurijad ja teadusajakirjade toimetajad.

17.02.2012 15:13

Uus suund evolutsioonis: prioonvalgud aitavad pärmidel ellu jääda

Pärmid elavad rasked ajad üle prioonide abiga.

13.02.2012 10:16

Pisike rakett viib inimkehas ravimeid kohale

California ülikooli teadlaste loodud silmale nähtamatud raketid kasutavad kütusena maohappes leiduvaid vesinikumulle.

08.02.2012 09:00

Masinate tulevik: ökorobotid (1)

Tulevikus võivad robotid kasutada energiaallikana väljaheiteid ja biojäätmeid.

06.02.2012 15:47

Ravim matkib punase veini kasulikku toimet

Hiigelkoguste veini sissekallamise asemel saab tervisele kasuliku toime kätte nüüd tabletist.